Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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