Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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