Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema6aO35464 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms