Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms