Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad6O35182 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms