Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms