Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms