Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Barx2O08686 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Barx2O08686 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx2O08686 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms