Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3aO08665 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3aO08665 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3aO08665 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3aO08665 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3aO08665 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3aO08665 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3aO08665 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3aO08665 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3aO08665 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3aO08665 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3aO08665 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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