Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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