Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms