Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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