Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930544D05RikJ3QK56 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms