Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm21818J3KMS6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm21818J3KMS6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm21818J3KMS6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm21818J3KMS6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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