Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm17535J3KMR8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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