Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms