Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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