Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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