Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Raph1F2Z3U3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms