Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms