Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms