Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ApobE9Q414 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms