Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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