Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim30bE9PVL6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms