Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms