Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms