Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms