Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms