Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9230113P08RikD3YWX3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms