Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt4B2RU40 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt4B2RU40 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt4B2RU40 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt4B2RU40 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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