Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp2c2A7L9Z8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms