Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms