Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms