Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd7A2AJK6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd7A2AJK6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd7A2AJK6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd7A2AJK6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd7A2AJK6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd7A2AJK6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd7A2AJK6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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