Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel3A2AHA7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel3A2AHA7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel3A2AHA7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel3A2AHA7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramel3A2AHA7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms