Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trav12-2A0N8N6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trav12-2A0N8N6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trav12-2A0N8N6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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