Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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