Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms