Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms