Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd3Q9Z2D8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms