Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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Cldn8Q9Z260 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn8Q9Z260 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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