Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms