Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms