Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmg20bQ9Z104 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20bQ9Z104 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms