Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AireQ9Z0E3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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AireQ9Z0E3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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AireQ9Z0E3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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