Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVC5

Trpc7, Short transient receptor potential channel 7, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc7Q9WVC5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trpc7Q9WVC5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc7Q9WVC5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc7Q9WVC5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc7Q9WVC5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc7Q9WVC5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc7Q9WVC5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Trpc7Q9WVC5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc7Q9WVC5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc7Q9WVC5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc7Q9WVC5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trpc7Q9WVC5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trpc7Q9WVC5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trpc7Q9WVC5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trpc7Q9WVC5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trpc7Q9WVC5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trpc7Q9WVC5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc7Q9WVC5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms