Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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