Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms