Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms