Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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